October 21
Oltre a microscopi e piastre di Petri, i computer sono uno strumento importante per microbiologi. Software per la ricerca microbiologia include strumenti utilizzati da altre discipline scientifiche e ingegneristiche, nonché applicazioni specializzate per lo studio di batteri e altri microrganismi. Molte applicazioni sviluppate da agenzie governative, fondazioni senza scopo di lucro o ricercatori universitari sono disponibili come software gratuito per scaricare e utilizzare come esperimento o di laboratorio richiede.
Un quadro fisico o mentale dei dati grezzi si raccolgono può aiutare a meglio cogliere la sua qualità, il significato e le implicazioni. Open source e software di visualizzazione dati commerciali sono ampiamente disponibili per la ricerca microbiologia. Creare tabelle e grafici dei dati usando LibreOffice Calc, Microsoft Excel o il sistema di data-visualizzazione Mondrian. Cell-O e applicazioni RasMol consentono di creare modelli 2D e 3D animati di molecole biologicamente significative come le proteine e aminoacidi.
Le grandi raccolte di dati microbiologia spesso producono informazioni più significative, una volta che sono state numericamente analizzati. pacchetti software MATLAB, Octave e SciPy che eseguono matematica raffinatezza, l'analisi e la modellazione dei dati degli scienziati. Usare questi pacchetti per fare parametro stima attraverso curve fitting, le previsioni epidemiologiche, simulazioni di crescita batterica e il rumore dei dati o l'eliminazione effetto stocastico. Queste applicazioni eseguire anche calcoli statistici, come l'analisi della varianza e test chi-quadrato.
applicazioni software Microbiologia anche aiutare a visualizzare le informazioni e la mia dalla sequenza di acidi nucleici che compongono il DNA di una di microrganismo. Il Bioinformatics Foundation aperto fornisce libero, open-source di sequenziamento del DNA e analisi applicazioni come BioJava e Biopython che estraggono dati da banche dati sul genoma, analizza il codice del DNA di un organismo e confrontarlo con altri campioni di DNA. Ulteriori pacchetti di analisi del genoma comprendono rilievo, HMMER, Clustal Omega, filogenesi Inference Package, o PHYLIP, e la sequenza di manipolazione Suite, o SMS.
Il rapido ritmo della scoperta scientifica in microbiologia e regolamenti governativi che cambiano rende indispensabile che i microbiologi hanno accesso immediato alle informazioni che gli impatti loro lavoro. HUGO è un pacchetto software commerciale che fornisce microbiologi con informazioni aggiornate sugli strumenti, prodotti chimici, attrezzature, terreni di coltura, i requisiti di sicurezza, nuovi organismi, i cambiamenti tassonomici e antibiotici. Inoltre, microbiologi che lavorano nel campo della scienza alimentare possono utilizzare l'applicazione Web Browser ComBase per accedere ai dati microbiologici legati agli alimenti forniti dalle agenzie governative nel Regno Unito, Australia e Stati Uniti.