L'estensione del file PDB l'acronimo di "banca dati di proteine" e contiene al suo testo che descrive la struttura tridimensionale delle proteine ​​molecolari. Viene utilizzato per memorizzare le informazioni nella banca dati di proteine, che è un database in continua crescita che organizza tutte le proteine ​​note. Il tipo di file FASTA è utilizzato dal software di analisi del DNA per fare rappresentazioni bidimensionali delle proteine ​​e di valutare la loro somiglianza. file PDB possono essere convertiti in file FASTA, in modo che queste rappresentazioni bidimensionali di proteine ​​possono essere studiate. Le rappresentazioni bidimensionali sono molto più semplici da analizzare e confrontare rispetto alla versione tridimensionale, ed è per questo motivo che i ricercatori a volte preferiscono fare il loro lavoro nel software FASTA.

istruzione

1 Scarica l'Advanced Converter proteine ​​sequenza collegata in Risorse. Questo è l'unico software disponibile che converte PDB per FASTA.

2 Installare il convertitore avanzato Protein Sequence sul computer.

3 Aprire l'avanzato programma di conversione delle proteine ​​sequenza.

4 Fai clic su "File" e poi "Apri file".

5 Selezionare il file PDB dalla finestra del browser che si apre.

6 Fai clic su "Apri".

7 Scegliere "Per FASTA Format" in "Export" voce nella parte in basso a destra del programma.

8 Fai clic su "Opzioni" e poi "Impostazioni".

9 Scegliere la lunghezza della stringa si preferisce il file FASTA da esportare in.

10 Fai clic su "OK".

11 Fare clic sul pulsante "Esporta". Il file PDB sarà ora convertito in un file FASTA con le lunghezze di stringa proteina che si designate.