Come leggere un file volumetrico in VMD

August 27

dati volumetrici sono dati 3D che tiene conto della posizione, la densità e la potenziale chimico dei dati molecolari a VMD (Visual Molecular Dynamics, un tipo di software). La lettura di un file di volumetrica in VMD richiede l'apertura in modo corretto. Alcuni altri file devono essere caricati e le impostazioni devono essere configurate per assicurarsi che si sta visualizzando tutti i dati volumetrici correttamente. Una volta fatto questo una volta, però, si può aprire e leggere i file volumetrici.

istruzione

1 Aprire VMD. Non aprire ancora il file volumetrico.

2 Tipo "volmap-density.dx" nella barra di ricerca del menu Start. Fare clic sul file quando appare sopra. Questo caricherà il file di configurazione in VMD.

3 Selezionare "caricare i dati in Molecola" dal menu File VMD.

4 Selezionare il file volumetrico e cliccare su "Apri". Viene mostrato un piccolo, versione steso dei dati volumetrici.

5 Cambiare "Slice asse" a "Y" nel pannello "Opzioni". Cambiare "Render Qualità" a "Medio" e "metodo di colorazione" a "Volume" anche lì. Ora i dati volumetrici verranno visualizzati correttamente in VMD.