February 16
Il Protein Data Bank (PDB) è un archivio on-line di informazioni circa le strutture di proteine, complessi proteici e acidi nucleici - DNA e filamenti di RNA. Il PPB fornisce strumenti per la ricerca nell'archivio, così come organizzare e annotare i dati. I ricercatori possono guardare le immagini tridimensionali di strutture proteiche e nucleico-acido, e utilizzare strumenti online per manipolare le immagini. Il sito contiene anche i dati sperimentali, risorse e informazioni su famiglie di proteine e le interazioni. Il Collaboratory di ricerca per bioinformatica strutturale mantiene la banca dati.
1 Selezionare gli argomenti dai menu sul lato sinistro dello schermo. Il menu PDB-101 mette in evidenza una "Molecola del Mese", un articolo mensile che vi mostrerà un esempio di molecole che si trovano nel database. "Capire PDB dati" dettagli il tipo di informazioni è possibile cercare nel PPB.
2 Inserisci un termine di ricerca nella casella di ricerca nella parte superiore della pagina. Possibili ricerche includono un ID di database; un nome molecola; una sequenza proteica; o l'autore di un documento di ricerca o di un progetto. La scatola prende anche le ricerche jolly, operatori booleani - "e" oppure "o", per esempio - e le citazioni di frasi esatte come parametri di ricerca che vi porterà alla pagina giusta.
3 Utilizzare le schede nella parte superiore delle pagine specifiche per selezionare le informazioni che volete su una particolare molecola. Cliccando le schede sulla pagina per la proteina dito anulare, una molecola di zinco-binding, è possibile conoscere la geometria molecolare della proteina; i metodi di ricerca utilizzati per analizzare esso; gli aminoacidi che costituiscono la proteina; e visualizzare elenchi di proteine con simili sequenze aminoacidiche o strutture tridimensionali.