file BAM sono formati binari di lettori sequencer. Essi memorizzare i dati scientifici nucleotide in un formato compresso, mescolando sia allineati e non allineati legge insieme. Essi sono controllati con lo strumento "bam2fastq", un comando di computer che viene installato con molti programmi nucleotide-sequenziamento (è anche possibile ottenere gratuitamente.) Per estrarre il unaligned legge da un file di BAM, quindi, tutto ciò che serve è Windows riga di comando.

istruzione

1 Tipo "bam2fastq" nella barra di ricerca del menu Start per assicurarsi di avere lo strumento (non c'è bisogno di aprirlo.) Se non lo fai, ottenere gratuitamente in Risorse.

2 Digitare "cmd.exe" nella barra di ricerca del menu Start. Fai clic su "cmd.exe" quando compare sopra. Questo apre la riga di comando di Windows.

3 Tipo "bam2fastq --unaligned FILELOCATION.bam" (senza virgolette) nella finestra di comando.

4 Sostituire "FILELOCATION" con la posizione del file BAM. Utilizzare il formato C: \ Cartella1 \ Folder2 \ File.bam ".

5 Premere "Invio". Questo aprirà una finestra di testo con il unaligned legge da quel particolare file BAM.