Come aprire un file PDB

August 2

Come aprire un file PDB


Protein Data Bank utilizza un formato PDB per memorizzare i dati strutturali determinati sperimentalmente di proteine ​​e acidi nucleici. Un file PDB è un file di testo che si compone di due parti: un colpo di testa e un elenco di coordinate atomiche. L'intestazione è in genere i primi 300 a 600 righe del file che contiene le informazioni relative alla proteina (ad esempio nome, di riferimento, la sequenza e le statistiche cristallografiche) ed è raggiungibile con l'apertura come file di testo. coordinate atomiche consentire la visualizzazione di una struttura proteica utilizzando alcuni programmi ad esempio DS Visualizer, uno che è un software gratuito da Acccelrys Inc.

istruzione

con WordPad

1 Individuare il file PDB utilizzando Windows Explorer.

2 Fare clic per espandere l'elenco "Altri programmi". Scorrere l'elenco e trovare "WordPad".

3 Fare doppio clic su "WordPad" per aprire il file PDB all'interno dell'editor.

4 Scorrere verso il basso il file e leggere le informazioni proteina.

Con Accelrys DS Visualizer

5 Fai clic su "Start" in Windows XP / Vista e aprire la lista "Tutti i programmi".

6 Scorrere l'elenco dei programmi e trovare la cartella "Accelrys DS Visualizer". Aprire la cartella e cliccare su "DS Visualizer" per avviare il programma. Nota: Invece dei punti 1 e 2, è possibile fare clic sull'icona DS Visualizer sul desktop.

7 Fare clic sul menu "File"> "Apri" in DS Visualizer. Individuare il percorso del file PDB e fare doppio clic sul file. La struttura dovrebbe apparire nella finestra DS Visualizer.

Accelrys DS Visualizer installazione

8 Passare al modulo di registrazione Discovery Studio Visualizer.

9 Compila il modulo di registrazione con la semplice informazione (il nome, l'appartenenza, indirizzo e indirizzo e-mail). Fai clic su "Invia modulo".

10 Selezionare la casella di posta elettronica indicato al punto 2 a 3 a 5 minuti. Si dovrebbe ricevere una email da Accelrys con il soggetto "DS Visualizer ... Informazioni sul download".

11 Apri l'email e clicca sul link a destra sotto la voce "DS Visualizer per Windows." Quindi fare clic su "Esegui" per salvare il file in una directory temporanea e automaticamente avviare l'installazione dopo.

12 Fare clic su "Esegui" e poi "Next" per avviare l'installazione. L'installazione richiede da 2 a 4 minuti.